タンパク質の二次構造について DSSP で計算した結果と図のそれを合わせたいときに、必要な PyMOL スクリプトを自動生成するプログラムを Ruby で書いてみた。

クリスタルコンタクトに関係するアミノ酸残基を CSV で出力するプログラムを書いた。

研究の経過発表を英語で行わなければならないらしいので、慣れない英語文章の組み立てに格闘中。ゴールデンウィークの間の平日で完成すればいいが… 前回のドメイン間の角度を求める方法、「３次元空間での直線回帰 - NARKIVE」を見ると座標の主成分分析でい…

ある論文に、特に方法は明記されずタンパク質のドメイン間の角度が書かれていたので、それを求めるアルゴリズムを考えてみた。